Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

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• waitForPluginParams() : TVToolDiscovery
• waitForToolParams() : TVToolDiscovery
• warning() : MzMLHandlerHelper, XMLHandler, XMLValidator
• wasChanged() : TOPPASScene
• water() : EmpiricalFormula
• weightData() : TransformationModel
• weightDatum() : TransformationModel
• weightedTICScore() : XQuestScores
• weightedTICScoreXQuest() : XQuestScores
• Weights() : Weights
• weightScore_() : MRMFeatureSelector, MRMFeatureSelector_test
• what_() : GlobalExceptionHandler
• wheelEvent() : PlotCanvas, TOPPASWidget
• widgetToData() : Plot1DCanvas
• widgetToData_() : PlotCanvas
• widgetToDataDistance() : Plot1DCanvas
• width() : DIntervalBase< D >
• window_() : TOPPASBase
• WindowMower() : WindowMower
• WizardGUILock() : WizardGUILock< TWidgetClass >
• wrap_() : XQuestResultXMLFile
• writable() : File
• write() : SVOutStream, XTandemInfile
• writeArgumentsLog_() : XFDRAlgorithm
• writeAttCsvForQscoreTraining() : PeakGroupScoring
• writeAttCsvForQscoreTrainingHeader() : PeakGroupScoring
• writeAttributeIfExists_() : MzXMLHandler
• writeBinary_() : MzDataHandler
• writeBinaryDataArray_() : MzMLHandler
• writeBinaryFloatDataArray_() : MzMLHandler
• writeChromatogram_() : CachedMzMLHandler, MzMLHandler
• writeChromatograms() : MzMLSqliteHandler
• writeConfiguration_() : TraMLHandler
• writeContainerData_() : MzMLHandler
• writeCTDToStream() : ParamCTDFile
• writeCV_() : MzMLHandler
• writeCVList_() : TraMLHandler
• writeCVParams_() : TraMLHandler
• writeCVS_() : MzDataHandler
• writeCWLToStream() : ParamCWLFile
• writeDataProcessing_() : MzMLHandler
• writeDebug_() : TOPPBase
• writeDebugOutput() : MultiplexFilteredMSExperiment
• writeDeconvolvedMasses() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeDeconvolvedMassesHeader() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeEnd() : FASTAFile
• writeEnzyme_() : MzIdentMLHandler
• writeExperiment() : MzMLSqliteHandler
• writeFeature_() : FeatureXMLHandler
• writeFeatureDebugInfo_() : FeatureFinderAlgorithmPicked
• writeFeatures() : FLASHDeconvFeatureFile
• writeFooter_() : MzMLHandlerHelper
• writeFragmentAnnotations_() : IdXMLFile, MzIdentMLHandler
• writeFromPercolator() : OSWFile
• writeHeader() : FLASHDeconvFeatureFile, OpenSwathOSWWriter
• writeHeader_() : MzMLHandler, MascotGenericFile
• writeHills() : Biosaur2Algorithm
• writeHist() : PrecursorCorrection
• writeIniFile_() : DBSuitability
• writeIsobaricQuantification() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeLines() : OpenSwathOSWWriter
• writeLog_() : FLASHDeconvTabWidget, SwathTabWidget
• writeLogError_() : TOPPBase
• writeLogInfo_() : TOPPBase
• writeLogWarn_() : TOPPBase
• writeMemdump() : CachedMzMLHandler
• writeMetadata() : CachedMzMLHandler
• writeMetadata_x() : CachedMzMLHandler
• writeMetaInfos_() : MzIdentMLHandler
• writeModifications_() : MascotGenericFile
• writeModificationSummary_() : OpenSearchModificationAnalysis
• writeModParam_() : MzIdentMLHandler
• writeMSExperiment_() : MascotGenericFile
• writeMsFile_() : SiriusMSFile
• writeMzIdentMLFile() : MzIdentMLDOMHandler
• writeMzML() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeNext() : FASTAFile
• writeNote_() : XTandemInfile
• writeOutFeaturesAndChroms_() : OpenSwathWorkflow
• writeParam_() : TOPPASToolVertex
• writeParameterHeader_() : MascotGenericFile
• writeParametersToMetaValues() : DefaultParamHandler
• writePeakAnnotationsString_() : PeptideHit::PeakAnnotation
• writePeptideHeader_() : MzTabFile
• writePeptideHit() : MzIdentMLHandler
• writePeptideIdentification_() : ConsensusXMLHandler, FeatureXMLHandler
• writePQPOutput_() : TransitionPQPFile
• writePrecursor_() : MzMLHandler
• writeProblem() : LPWrapper
• writeProduct_() : MzMLHandler, TraMLHandler
• writeProteinData_() : MzTabFile
• writeProteinHeader_() : MzTabFile
• writeResults_() : Ms2IdentificationRate
• writeRetentionTime_() : TraMLHandler
• writeRunLevelInformation() : MzMLSqliteHandler
• writeSoftware_() : MzMLHandler
• writeSourceFile_() : MzMLHandler
• writeSpectra() : MzMLSqliteHandler
• writeSpectrum() : MascotGenericFile
• writeSpectrum_() : CachedMzMLHandler, MzMLHandler
• writeStart() : FASTAFile
• writeSupplementaryPairTable() : IonIdentityMolecularNetworking
• writeTarget_() : TraMLHandler
• writeTo() : ConsensusXMLHandler, FeatureXMLHandler, MzDataHandler, MzIdentMLHandler, MzMLHandler, MzXMLHandler, PTMXMLHandler, ToolDescriptionHandler, TraMLHandler, XMLHandler, XQuestResultXMLHandler
• writeTo_() : XTandemInfile
• writeToFile() : TOPPASResource
• writeToLogFile_() : TOPPASScene
• writeToolDescription_() : TOPPBase
• writeTopFD() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeTopFDFeatureHeader() : FLASHDeconvFeatureFile
• writeTopFDFeatures() : FLASHDeconvFeatureFile
• writeTopFDHeader() : FLASHDeconvSpectrumFile
• writeToStream() : ParamJSONFile
• writeTSV() : Biosaur2Algorithm, ModificationsDB, ProteaseDB
• writeTSVOutput_() : TransitionTSVFile
• writeUserParam_() : MzDataHandler, MzMLHandler, MzXMLHandler, TraMLHandler, XMLHandler
• writeUserParams_() : TraMLHandler
• writeValueOrNan() : SVOutStream
• writeWhitelistCases_() : FuzzyStringComparator
• writeXLMSPeptideHit() : MzIdentMLHandler
• writeXMLEscape() : XMLHandler
• writeXMLToStream() : ParamXMLFile
• writeXQuestXMLSpec() : XQuestResultXMLFile
• writeXvalResults() : SimpleSVM
• WrongParameterType() : WrongParameterType