Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

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• H : ImmoniumIonsInPeptide, ExtendedIsotopeModel, IsotopeModel
• half_raw : AdaptiveQuantileResult
• half_rob : AdaptiveQuantileResult
• halflogtwopi : GaussFitter::GaussFitResult
• handleBinaryDataArray_() : MzMLSpectrumDecoder
• handleBinaryDataArrayCVParam() : MzMLHandlerHelper
• handleCVParam_() : MzIdentMLHandler, MzMLHandler, TraMLHandler
• handleExternalFeature_() : FFIDAlgoExternalIDHandler
• handleFeatureExport_() : IdentificationDataConverter
• handleFeatureImport_() : IdentificationDataConverter
• handleIdDataScoreType_() : MapAlignmentAlgorithmIdentification
• HandleIterator : MapAlignmentEvaluationAlgorithm
• handleObservationMatch_() : FalseDiscoveryRate
• handlePTMs() : InspectInfile, SequestInfile
• handlePTMs_() : PepNovoInfile
• handleQueryAppliedProcessingStep_() : OMSFileLoad
• handleQueryMetaInfo_() : OMSFileLoad
• handleQueryParentMatch_() : OMSFileLoad
• handleQueryPeakAnnotation_() : OMSFileLoad
• handler_ : MSDataSqlConsumer, SpectrumAccessSqMass
• handles_ : ConsensusFeature
• HandleSetType : ConsensusFeature
• handleTerm_() : MzDataValidator, MzMLValidator, SemanticValidator
• handleUserParam_() : MzIdentMLHandler, MzMLHandler, TraMLHandler
• HARDKLOER : FileTypes
• harmonic_pattern_matrix_ : SpectralDeconvolution
• has() : AASequence, ModificationsDB, String
• has_centroid_im_ : MassTraceDetection
• has_decoys_ : PepXMLFile
• has_fraction_ : MSstatsFile::MSstatsLine_
• has_fwhm_im_ : MassTraceDetection
• has_fwhm_mz_ : MassTraceDetection
• has_H2O_loss : SimpleTSGXLMS::LossIndex, TheoreticalSpectrumGeneratorXLMS::LossIndex
• has_hit : ACNode::DepthHits
• has_intensity_range_ : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• has_mz_range_ : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• has_NH3_loss : SimpleTSGXLMS::LossIndex, TheoreticalSpectrumGeneratorXLMS::LossIndex
• has_precursor_mz_range_ : PeakFileOptions
• has_rt_range_ : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• has_SCOREMS2_ : OSWFile
• has_uncommited_data_ : ParamEditorDelegate
• has_unit_accession : SemanticValidator::CVTerm
• has_unit_name : SemanticValidator::CVTerm
• has_value : SemanticValidator::CVTerm
• HasActivationMethod() : HasActivationMethod< SpectrumType >
• hasBetterScore() : NuXLAnnotatedHit, PeptideSearchEngineFIAlgorithm::AnnotatedHit_, SimpleSearchEngineAlgorithm::AnnotatedHit_
• hasCentroidIm() : MassTraceDetection
• hasCharge() : PeptideCompound, TraMLProduct
• hasChromatogram() : MRMTransitionGroup< ChromatogramType, TransitionType >
• hasCNterminalMods_() : MRMDecoy
• hasCNterminalModsLight_() : MRMDecoy
• hasCompound() : TargetedExperiment
• hasCTerminalModification() : AASequence
• hasCVReference() : CVMappings
• hasCVTerm() : CVTermList, CVTermListInterface
• hasData() : DataTabBase, DIATreeTab, SpectraIDViewTab, SpectraTreeTab
• HasDecoyAnnotation() : IDFilter::HasDecoyAnnotation< HitType >
• hasElement() : ElementDB, EmpiricalFormula
• hasEnzyme() : DigestionEnzymeDB< DigestionEnzymeType, InstanceType >
• hasError() : MascotRemoteQuery, NetworkGetRequest
• hasFactor() : ExperimentalDesign::SampleSection
• hasFilters() : PeakFileOptions
• hasFivePrimeMod() : NASequence
• hasFollowUpScan : IsobaricChannelExtractor::PurityState_
• hasFwhmIm() : MassTraceDetection
• hasFwhmMz() : MassTraceDetection
• HasGoodScore() : IDFilter::HasGoodScore< HitType >
• hash : MzTabMMSRunMetaData
• hash_method : MzTabMMSRunMetaData
• hash_type : ConsensusMapMergerAlgorithm, IDMergerAlgorithm
• HashGrid : HashGrid< Cluster >::ConstIterator, HashGrid< Cluster >, HashGrid< Cluster >::Iterator
• hasIndex() : LayerData1DBase, LayerData1DChrom, LayerData1DIonMobility, LayerData1DPeak, MzMLFile
• hasInferenceData() : ProteinIdentification
• hasInferenceEngineAsSearchEngine() : ProteinIdentification
• hasIntensityRange() : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• HasInvalidLength() : NucleicAcidSearchEngine::HasInvalidLength
• hasInvalidUniqueId() : UniqueIdInterface
• hasInverseOrientation() : AxisWidget
• hasLowIntensityReporter_() : IsobaricChannelExtractor
• HasMatchingAccession() : IDFilter::HasMatchingAccession< HitType >
• HasMatchingAccessionUnordered() : IDFilter::HasMatchingAccessionUnordered< HitType >
• HasMaxMetaValue() : IDFilter::HasMaxMetaValue< HitType >
• HasMetaValue() : HasMetaValue< MetaContainer >, IDFilter::HasMetaValue< HitType >
• HasMinMetaValue() : IDFilter::HasMinMetaValue< HitType >
• hasMSLevels() : PeakFileOptions
• hasMZ() : PeptideIdentification
• hasMZRange() : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• hasName() : IMSAlphabet
• hasNeutralLoss() : Residue, ResidueModification
• hasNTerminalModification() : AASequence
• hasNTermNeutralLosses() : Residue
• hasPepID() : QCBase
• hasPeptide() : TargetedExperiment
• hasPeptideIdentifications_() : MQExporterHelper
• HasPrecursorCharge() : HasPrecursorCharge< SpectrumType >
• hasPrecursorChromatogram() : MRMTransitionGroup< ChromatogramType, TransitionType >
• hasPrecursorCVTerms() : ReactionMonitoringTransition
• hasPrecursorMZRange() : PeakFileOptions
• hasPrediction() : ReactionMonitoringTransition
• hasPrefix() : AASequence, String
• hasPrimaryID() : BaseFeature
• hasProtein() : TargetedExperiment
• hasRange() : RangeManager< RangeBases >
• hasRegEx() : DigestionEnzymeDB< DigestionEnzymeType, InstanceType >
• hasResidue() : ResidueDB
• hasRetentionTime() : PeptideCompound
• hasRT() : PeptideIdentification
• hasRTRange() : FeatureFileOptions, PeakFileOptions
• hasRTTransformation() : FFIDAlgoExternalIDHandler
• hasSample() : ExperimentalDesign::SampleSection
• HasScanMode() : HasScanMode< SpectrumType >
• HasScanPolarity() : HasScanPolarity< SpectrumType >
• hasSection() : Param
• hasStream() : StreamHandler
• hasStream_() : LogStream
• hasSubsequence() : AASequence
• hasSubstring() : String
• hasSuffix() : AASequence, String
• hasTag() : Param
• hasTermWithName() : ControlledVocabulary
• hasThreePrimeMod() : NASequence
• hasTransition() : MRMTransitionGroup< ChromatogramType, TransitionType >
• hasUncommittedData() : ParamEditorDelegate
• hasUnit() : CVTerm, DataValue, DimMapper< N_DIM >
• hasValidExtension() : FileHandler
• hasValidLimits() : PeptideEvidence
• hasValidPepID_() : MQExporterHelper
• hasValidPositions() : ParentMatch
• hasValidUniqueId() : UniqueIdInterface
• hasValue() : CVTerm
• hasZeroIntensities() : MSExperiment
• HDF5Connector() : HDF5Connector
• head_ : CompressedInputSource
• header_ : QcMLFile
• header_names_ : TransitionTSVFile
• headerContextMenu_() : TableView, TreeView
• headerMatches() : FASTAFile::FASTAEntry
• Heap : QTClusterFinder
• height() : DIntervalBase< D >, PeakIntegrator::PeakArea, PeakIntegrator::PeakBackground
• height_ : EGHTraceFitter, EmgFitter1D, EmgModel, GaussTraceFitter, Plot3DOpenGLCanvas
• heightColor_() : Plot2DCanvas
• hidden_entries_ : TOPPASToolConfigDialog
• hide_no_identification_ : SpectraIDViewTab
• hideAxes() : Plot1DWidget, PlotWidget
• hideColumns() : TableView, TreeView
• high_im_ : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• high_mz_ : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• higher_better : ScoreType
• higher_better_ : IDScoreSwitcherAlgorithm, PeptideIdentificationVisualizer, ProteinIdentificationVisualizer
• higher_is_better : PeptideHit::PepXMLAnalysisResult
• higher_score_better : IDFilter::HasGoodScore< HitType >
• higher_score_better_ : PeptideIdentification, ProteinIdentification
• highIM() : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• highlightElement() : Painter2DBase, Painter2DConsensus, Painter2DFeature
• highlightPeak_() : Plot2DCanvas
• highMZ() : AreaIterator< ValueT, ReferenceT, PointerT, SpectrumIteratorT, PeakIteratorT >::Param
• hill_idx : Biosaur2Algorithm::Hill, Biosaur2Algorithm::IsotopeCandidate
• hill_index : Biosaur2Algorithm::FastHillEntry
• Histogram() : Histogram< ValueType, BinSizeType >
• histogram_oob_percent_ : SignalToNoiseEstimatorMedian< Container >
• HistogramDialog() : HistogramDialog
• HistogramWidget() : HistogramWidget
• Hit() : FragmentIndex::Hit, Hit
• hit_pev_ : MzIdentMLDOMHandler
• hits : ACTrieState
• hits_ : FragmentIndex::SpectrumMatchesTopN, SpectrumIdentification, PeptideIdentification
• HitsByScore : NucleicAcidSearchEngine
• hitting_peak_count : MassTraceDetection::TraceExtensionState
• HitType : PeptideIdentification, ProteinIdentification
• hmdb_properties_mapping_ : AccurateMassSearchEngine
• HMDBPropsMapping : AccurateMassSearchEngine
• horizontalScrollBarChange() : Plot1DCanvas, Plot2DCanvas, PlotCanvas
• host_name_ : MascotRemoteQuery
• hover_edge_ : TOPPASScene
• hover_pos_ : TOPPASEdge
• hoveringEdgePosChanged() : TOPPASVertex
• HPLC() : HPLC
• hplc_ : ExperimentalSettings
• hplccolumn_ : HPLCVisualizer
• hplccomment_ : HPLCVisualizer
• hplcflux_ : HPLCVisualizer
• hplcinstrument_ : HPLCVisualizer
• hplcpressure_ : HPLCVisualizer
• hplctemperature_ : HPLCVisualizer
• HPLCVisualizer() : HPLCVisualizer
• hrttol_ : Biosaur2Algorithm
• HTML : FileTypes
• html_code_ : Ribonucleotide
• htol_ : Biosaur2Algorithm
• hull_points : PeakIntegrator::PeakArea
• hull_position_ : FeatureXMLHandler
• HullPointType : ConvexHull2D
• hvf_ : Biosaur2Algorithm
• hydrogen() : EmpiricalFormula
• hydrogen_ : PepXMLFile
• hydrogen_mass_ : PepXMLFile
• HYPOTHETICAL : ResidueModification